MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 plasmid pMLa

Total Repeats: 7227

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_002679	GCC	2	6	224185	224190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4502	NC_002679	ATT	2	6	224195	224200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_002679	AAT	2	6	224245	224250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_002679	TTC	2	6	224332	224337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4505	NC_002679	GGCA	2	8	224344	224351	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4506	NC_002679	CGC	2	6	224421	224426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4507	NC_002679	GAT	2	6	224442	224447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_002679	CGC	2	6	224597	224602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4509	NC_002679	CAC	2	6	224631	224636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4510	NC_002679	CCATC	2	10	224674	224683	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
4511	NC_002679	CGAT	2	8	224704	224711	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4512	NC_002679	ATG	2	6	224722	224727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_002679	AGG	2	6	224742	224747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_002679	GTTCGC	2	12	224768	224779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488256
4515	NC_002679	CGG	2	6	224789	224794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488256
4516	NC_002679	TTC	2	6	224805	224810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488256
4517	NC_002679	CGC	2	6	224879	224884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488256
4518	NC_002679	TGA	2	6	224960	224965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488256
4519	NC_002679	TCA	2	6	225154	225159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4520	NC_002679	CGA	2	6	225288	225293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4521	NC_002679	TTGTGT	2	12	225506	225517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488257
4522	NC_002679	CG	3	6	225697	225702	0 %	0 %	50 %	50 %	13488257
4523	NC_002679	CAAGG	2	10	225728	225737	40 %	0 %	40 %	20 %	13488257
4524	NC_002679	CAC	2	6	225770	225775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488257
4525	NC_002679	GAA	2	6	225793	225798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488257
4526	NC_002679	GCTT	2	8	225813	225820	0 %	50 %	25 %	25 %	13488257
4527	NC_002679	GCT	2	6	225955	225960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488257
4528	NC_002679	CGG	2	6	226029	226034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488257
4529	NC_002679	AAG	2	6	226052	226057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488257
4530	NC_002679	CCCG	2	8	226088	226095	0 %	0 %	25 %	75 %	13488257
4531	NC_002679	TGG	2	6	226099	226104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488257
4532	NC_002679	CGC	2	6	226134	226139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488257
4533	NC_002679	TCGA	2	8	226271	226278	25 %	25 %	25 %	25 %	13488257
4534	NC_002679	ACG	2	6	226329	226334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488257
4535	NC_002679	TGC	2	6	226401	226406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488257
4536	NC_002679	CGG	2	6	226407	226412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488257
4537	NC_002679	CAG	2	6	226589	226594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488257
4538	NC_002679	GGCA	3	12	226613	226624	25 %	0 %	50 %	25 %	13488257
4539	NC_002679	GAA	2	6	226790	226795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488258
4540	NC_002679	CAA	2	6	226831	226836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488258
4541	NC_002679	TGG	2	6	226966	226971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488258
4542	NC_002679	GCG	2	6	227012	227017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488258
4543	NC_002679	GCGG	2	8	227036	227043	0 %	0 %	75 %	25 %	13488258
4544	NC_002679	ATG	2	6	227093	227098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488339
4545	NC_002679	TGC	2	6	227141	227146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488339
4546	NC_002679	CCT	2	6	227157	227162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488339
4547	NC_002679	CGA	2	6	227166	227171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488339
4548	NC_002679	ACG	2	6	227300	227305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488339
4549	NC_002679	GGC	2	6	227332	227337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488339
4550	NC_002679	AG	3	6	227369	227374	50 %	0 %	50 %	0 %	13488339
4551	NC_002679	C	6	6	227413	227418	0 %	0 %	0 %	100 %	13488339
4552	NC_002679	GCAG	2	8	227445	227452	25 %	0 %	50 %	25 %	13488339
4553	NC_002679	TGG	2	6	227523	227528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488339
4554	NC_002679	CGG	2	6	227604	227609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488339
4555	NC_002679	ATT	2	6	227624	227629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	13488339
4556	NC_002679	GTT	2	6	227657	227662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_002679	GTCG	2	8	227667	227674	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4558	NC_002679	CG	3	6	227711	227716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4559	NC_002679	AGG	2	6	227774	227779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_002679	GTC	2	6	227782	227787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4561	NC_002679	TGT	2	6	227852	227857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_002679	CG	3	6	227980	227985	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4563	NC_002679	GC	3	6	227998	228003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4564	NC_002679	CA	3	6	228015	228020	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4565	NC_002679	ATC	2	6	228081	228086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4566	NC_002679	GCC	2	6	228112	228117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4567	NC_002679	ACC	2	6	228130	228135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4568	NC_002679	GAA	2	6	228143	228148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_002679	CAA	2	6	228230	228235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4570	NC_002679	ATT	2	6	228245	228250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_002679	GGC	3	9	228280	228288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488259
4572	NC_002679	TGG	2	6	228291	228296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488259
4573	NC_002679	GAAG	2	8	228316	228323	50 %	0 %	50 %	0 %	13488259
4574	NC_002679	TGC	2	6	228376	228381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488259
4575	NC_002679	GAAG	2	8	228532	228539	50 %	0 %	50 %	0 %	13488259
4576	NC_002679	TCG	2	6	228552	228557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488259
4577	NC_002679	CG	3	6	228565	228570	0 %	0 %	50 %	50 %	13488259
4578	NC_002679	CGC	2	6	228588	228593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488259
4579	NC_002679	GC	3	6	228636	228641	0 %	0 %	50 %	50 %	13488259
4580	NC_002679	TA	3	6	228784	228789	50 %	50 %	0 %	0 %	13488259
4581	NC_002679	CGC	2	6	228796	228801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488259
4582	NC_002679	GCC	2	6	228844	228849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488259
4583	NC_002679	TCA	2	6	228882	228887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488259
4584	NC_002679	TCGG	2	8	228908	228915	0 %	25 %	50 %	25 %	13488259
4585	NC_002679	CGGC	2	8	228978	228985	0 %	0 %	50 %	50 %	13488259
4586	NC_002679	GCG	2	6	228986	228991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488259
4587	NC_002679	CAA	2	6	228995	229000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488259
4588	NC_002679	GGC	2	6	229034	229039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488259
4589	NC_002679	GAG	2	6	229104	229109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488259
4590	NC_002679	TGA	2	6	229116	229121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488260
4591	NC_002679	GAT	2	6	229132	229137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488260
4592	NC_002679	GTTCT	2	10	229283	229292	0 %	60 %	20 %	20 %	13488260
4593	NC_002679	GGC	2	6	229318	229323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488260
4594	NC_002679	TCGGC	2	10	229377	229386	0 %	20 %	40 %	40 %	13488260
4595	NC_002679	TCG	2	6	229392	229397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488260
4596	NC_002679	GATC	2	8	229446	229453	25 %	25 %	25 %	25 %	13488261
4597	NC_002679	TTG	2	6	229468	229473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488261
4598	NC_002679	CGG	2	6	229559	229564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488261
4599	NC_002679	GC	3	6	229720	229725	0 %	0 %	50 %	50 %	13488261
4600	NC_002679	CG	3	6	229751	229756	0 %	0 %	50 %	50 %	13488262
4601	NC_002679	TGA	2	6	229766	229771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488262
4602	NC_002679	TCG	2	6	229793	229798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488262
4603	NC_002679	CGA	2	6	229844	229849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488262
4604	NC_002679	CGAT	2	8	229915	229922	25 %	25 %	25 %	25 %	13488262
4605	NC_002679	TCGAG	2	10	230035	230044	20 %	20 %	40 %	20 %	13488262
4606	NC_002679	CGG	2	6	230086	230091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488262
4607	NC_002679	GCG	2	6	230141	230146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488262
4608	NC_002679	CGG	2	6	230170	230175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488262
4609	NC_002679	CGAG	2	8	230227	230234	25 %	0 %	50 %	25 %	13488262
4610	NC_002679	TGA	2	6	230263	230268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488262
4611	NC_002679	GA	3	6	230278	230283	50 %	0 %	50 %	0 %	13488262
4612	NC_002679	GC	3	6	230299	230304	0 %	0 %	50 %	50 %	13488262
4613	NC_002679	CGT	2	6	230315	230320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488262
4614	NC_002679	CGA	2	6	230434	230439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488262
4615	NC_002679	CAT	2	6	230510	230515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488262
4616	NC_002679	CAT	2	6	230609	230614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488262
4617	NC_002679	GC	3	6	230712	230717	0 %	0 %	50 %	50 %	13488262
4618	NC_002679	GAC	2	6	230790	230795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488262
4619	NC_002679	CCTG	2	8	230894	230901	0 %	25 %	25 %	50 %	13488262
4620	NC_002679	GC	3	6	230919	230924	0 %	0 %	50 %	50 %	13488262
4621	NC_002679	GAC	2	6	231032	231037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488262
4622	NC_002679	CTT	2	6	231053	231058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488262
4623	NC_002679	CTCGGG	2	12	231104	231115	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	13488262
4624	NC_002679	TGC	2	6	231124	231129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488262
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4626	NC_002679	CGC	2	6	231163	231168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488262
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4872	NC_002679	TGC	2	6	242066	242071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4873	NC_002679	GAC	2	6	242094	242099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4874	NC_002679	GCA	2	6	242101	242106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4875	NC_002679	TCG	2	6	242178	242183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4876	NC_002679	AC	3	6	242404	242409	50 %	0 %	0 %	50 %	13488272
4877	NC_002679	ATC	2	6	242463	242468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488272
4878	NC_002679	ACG	2	6	242523	242528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488272
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4880	NC_002679	GGC	2	6	242650	242655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488272
4881	NC_002679	CG	4	8	242732	242739	0 %	0 %	50 %	50 %	13488272
4882	NC_002679	AGTC	2	8	242785	242792	25 %	25 %	25 %	25 %	13488272
4883	NC_002679	GC	3	6	242822	242827	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4884	NC_002679	GA	3	6	242828	242833	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4885	NC_002679	AG	3	6	242834	242839	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4886	NC_002679	AAG	2	6	242868	242873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488273
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4888	NC_002679	CA	3	6	243020	243025	50 %	0 %	0 %	50 %	13488273
4889	NC_002679	TCG	2	6	243048	243053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488273
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4892	NC_002679	TGC	2	6	243181	243186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488273
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4904	NC_002679	GAA	2	6	243657	243662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4905	NC_002679	CCTG	2	8	243706	243713	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4906	NC_002679	CGT	2	6	243728	243733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4907	NC_002679	TGCT	2	8	243756	243763	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4908	NC_002679	GGGAC	2	10	243777	243786	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4909	NC_002679	AG	3	6	243803	243808	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4913	NC_002679	GCC	2	6	244161	244166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488274
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4997	NC_002679	GCCG	2	8	248123	248130	0 %	0 %	50 %	50 %	13488276
4998	NC_002679	CAT	2	6	248131	248136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488276
4999	NC_002679	GGC	2	6	248140	248145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488276
5000	NC_002679	CG	3	6	248187	248192	0 %	0 %	50 %	50 %	13488276

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